تأسس معهد الدراسات العليا للأكاديمية الصينية للعلوم الزراعية في عام 1979، وأصبح من الدفعة الأولى من وحدات منح درجتي الدكتوراه والماجستير في البلاد بموافقة مجلس الدولة في عام 1981.
بالاعتماد على 36 معهدا بحثيا في 16 مقاطعة (بلدية خاضعة للإدارة المركزية مباشرة ومنطقة ذاتية الحكم) في البلاد، قد شكّل معهد الدراسات العليا للأكاديمية الصينية للعلوم الزراعية نظام إعداد المواهب المتعدد المستويات والمتنوع والمتسم بالعالمية للماجستير والدكتوراه والدرجة الأكاديمية والدرجة المهنية للطلاب الوافدين.
تقوم الأكاديمية الصينية للعلوم الزراعية ببناء تخصصات الدراسات العليا وتحسين نظام التخصصات للدراسات العليا مع التركيز على تجمعاتها التخصصية التسعة الرئيسية، حيث تضم تخصصاتها حاليا 4 أبواب بينها الزراعة والعلوم والهندسة والإدارة، وتغطي 17 تخصصا من الدرجة الأولى.
في عام 2007، حصل معهد الدراسات العليا على الأهلية لتلقي الطلاب الوافدين إلى الصين بمنح الحكومة الصينية بموافقة وزارة التربية والتعليم؛ في عام 2008، قبل المعهد الدفعة الأولى من الطلاب الوافدين إلى الصين يهدفون للحصول على الدبلومات.